扬州工学院的前身扬州工业学校，是在扬州中学工科基础上创建的一所中等专科学校。校址位于当时的市区西南三元桥（今扬州大学江阳路北校区），占地面积约321亩。

1952年7月，苏北行政公署根据华东军政委员会教育部决定，将扬州中学工科的土建、机械、电机三个专业二年级，水利专业三年级学生，共计411人，全部专业教师、部分基础课程教师等调整到扬州工业学校。同时，苏北行政公署教育处又从苏北地区各中学抽调近50名教师来校任教。

建校之初，苏北区党委和苏北行政公署任命郭建兼任扬州工业学校校长。1952年11月8日，郭建卸去扬州工业学校校长职务，苏北行政公署委派张渤如到校任校长。同时，苏北区党委直属机关党委会批准张渤如任扬州工业学校党支部书记。

1952年11月14日，扬州工业学校借用扬州中学“树人堂”，举行开学典礼。开学时，全校学生共有1607人。学校设水利、土木、机械、电机和化工五个专业。在校学生数在苏北地区位居前列。

1953年9月，江苏省教育厅与第二机械工业部商定，扬州工业学校调整归属二机部领导，明确了为国防工业建设培养专业建设人才的任务。10月20日 第二机械工业部函教育部并抄送扬州工业学校，决定将扬州工业学校校名改为“华东第二工业学校”。

1955年8月，西安建筑工程学校并入该校，学校更名为“扬州建筑工程学校”。其后，学校划归第一机械工业部领导。

1958年7月 扬州建筑工程学校划归江苏省领导（省、地双重领导），由省重工业厅主管。同年，8月18日 扬州建筑工程学校改为扬州工业专科学校，并附设中专部，学制三年，暑期起参加全国高校统招。学校设三科5个专业：土木建筑科，设工业与民用建筑、给水排水专业；机械科，设机械制造及其设备专业；化工科，设无机化工专业。

1961年7月扬州工业专科学校改名为扬州农机专科学校。8月省政府决定无锡工专与扬州农机专科学校合并。

1962年7月至8月，常州、南通、盐城、淮阴、新海连等工业专科学校停办，部分师生并入。

1962年9月，恢复“扬州工业专科学校”校名。

1965年9月，学校划归第五机械工业部管理，经国务院批准，升格为“扬州工业学院”。成为苏北、苏中地区唯一一所工科本科院校。

“文化大革命”期间，1966年10月扬州工业学院“造反派”夺取学校领导权，并宣布将该院改名为“红旗工业大学”。

1969年6月第五机械工业部军管会通知，决定将扬州工业学院改办为第五机械工业部5308 厂(第二厂名为曙光仪器厂)，扬州工业学院停办。

1972年8月，第五机械工业部决定在原扬州工业学院基础上开办“扬州光学机械学校”，学校与工厂一个领导班子，对外既是学校又是工厂。

1978年10月，学校开办南京工学院扬州地区专科班。

1979年2月28日 为了恢复扬州工业学院，扬州地区行署给省人民政府（79）22号《关于迅速恢复扬州工业学院或工专的报告》。

1980年1月 扬州光机学校的隶属关系划归江苏省领导。

1980年1月，经国务院批准恢复“扬州工业专科学校”，隶属江苏省政府领导。同月，江苏省高教局下发《关于成立扬州工专筹建处的通知》

1981年7月，经国务院批准建立扬州工业专科学校。学制三年，规模1200人，设置机械制造，无线电技术，工业与民用建筑，供热与通风等专业，扬州工专实行省与地市双重领导、以省为主的管理体制。

1985年11月江苏省人民政府申请恢复扬州工学院。

1987年12月16日国家教委批准成立扬州工学院。

1992年5月，与扬州师范学院、江苏农学院、扬州医学院、扬州水利工程专科学校、江苏商业专业学校，联合组建扬州大学。