1952年，经报中共中央华东局、华东军政委员会批准，中共苏北区党委、苏北行政公署决定在扬州建立苏北农学院（江苏农学院前身）、苏北师范专科学校（扬州师范学院前身）和扬州工业学校（扬州工学院前身）三所大专院校，由此掀开了古城扬州发展高等教育的新篇章。

1950年6月苏北行政公署在高邮创办的“苏北卫生行政干部学校”（简称“苏北卫生学校”）。苏北行政公署主任惠浴宇兼任校长。

1952年8月，苏北卫生局报请华东军政委员会卫生部和上海市卫生局同意，上海私立惠生高级助产职业学校迁扬州，与苏北卫生行政干部学校合并，成立苏北扬州助产学校。这是扬州医学院的前身。

江苏省扬州商业学校，是1952年在私立镇江新华中学基础上创建的，原名苏南镇江商业学校。1953年，江苏建省时改称江苏省镇江商业学校。1955年8月，江苏省镇江商业学校迁至扬州，改名为江苏省扬州商业学校。

扬州师范学院的前生是创办于1952年的苏北师范专科学校。校址位于西郊瘦西湖与当年的庆隆寺之间（今扬州大学瘦西湖校区)1959年4月29日，苏北师范专科学校、扬州师专并校后改为扬州师范学院，设四系六科。5月1日，扬州师范学院正式宣布成立。

江苏水利工程专科学校的办学历史可追溯到1950年创建于南京的淮河水利专科学校。1951年11月，淮河水利专科学校更名为华东水利专科学校。1952年华东水利专科学校一部分改办中等专业学校，定名华东水利学校。1955年2月，改名为水利部南京水利学校。1958年9月，江苏省将学校升格为南京水利学院。1960年1月，南京水利学院迁校扬州，改称江苏水利学院。

1962年，苏北农学院首次获批招收研究生3人（截至1964年，有3个专业，7个学科共招收3届11名研究生，其中毕业10名）。这是扬州高校研究生教育的发端。

1971年11月23日，省革委会决定，南京农学院与苏北农学院合并，组建江苏农学院，校址设在原苏北农学院。 江苏农学院的前身是创建于1952年的苏北农学院。苏北农学院是新中国成立后，根据全国高校院系调整方案，在苏北区建设的首所本科院校。校址为于扬州西郊扫垢山（今扬州大学文汇路校区）。

1981年5月，国家农垦部和江苏省政府签署关于江苏农学院实行联合办学的协议。

1981年11月3日，经国务院学位委员会批准，扬州师范学院中国古代文学专业具有博士学位和硕士学位授予权，任中敏教授为博士生指导教师；江苏农学院作物栽培和农田水利工程2个专业首批获得硕士学位授予权。

江苏商业专科学校是1982年2月由江苏省商业学校（扬州）和南京商业专科学校合并而建立。校址位于扬州市区便益门附近（原为扬州大学盐阜路校区）。 1955年8月，江苏省镇江商业学校迁至扬州，改名为江苏省扬州商业学校。1979年春，南京商业专科学校恢复办学，并改名为江苏省商业专科学校。1982年2月，根据江苏省人民政府决定，江苏省商业专科学校迁来扬州，与江苏省商业学校合并成立新的江苏省商业学校。

江苏水利工程专科学校的办学历史可追溯到1950年创建于南京的淮河水利专科学校。 1960年1月，南京水利学院迁校扬州，改为江苏水利学院......1984年4月16日，江苏省政府发文建立江苏水利工程专科学校，同时保留江苏省扬州水利学校。

扬州医学院起源于1950年6月苏北行政公署在高邮创办的“苏北卫生行政干部学校”（简称“苏北卫生学校”）。

1951年2月，“苏北卫生学校”从高邮迁至扬州。1952年8月，上海私立惠生高级助产职业学校迁并来扬州，校址在北河下（今扬州市妇幼保健医院附近），校名为苏北扬州助产学校......1979年1月，经国务院批准恢复扬州医学专科学校。1984年7月，教育部批准扬州医学专科学校升格为扬州医学院。

扬州工学院的前身扬州工业学校，是在扬州中学工科基础上创建的一所中等专科学校。校址位于当时的市区西南三元桥（今扬州大学江阳路北校区）。 1953年9月，扬州工业学校调整归属二机部领导，校名改为“华东第二工业学校”。1958年8月18日学校改为扬州工业专科学校。1965年9月，经国务院批准，升格为“扬州工业学院”。成为苏北、苏中地区唯一一所工科本科院校。文革中，一度停办。1981年7月，经国务院批准建立扬州工业专科学校。1987年12月16日，国家教委批准成立扬州工学院。